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廣東順德中山大學卡內基梅隆大學國際聯合研究院40個樣品全轉錄組測序項目單一來源采購公示

信息發布日期:2015.04.23 標簽: 廣東省招標 
加入日期:2015.04.23
截止日期:2015.04.30
招標業主:廣東順德中山大學卡內基梅隆大學國際聯合研究院
地 區:廣東省
 
招標公告正文

    廣東順德中山大學卡內基梅隆大學國際聯合研究院擬采用單一來源方式進行40個樣品全轉錄組測序項目采購,經初步市場調查,該項目屬于《中華人民共和國政府采購法》第三十一條規定“只能從唯一供應商處采購的”情形。現按規定進行單一來源采購報批前公示,各供應商如有意見請在公示期內以書面形式傳真反饋。同時邀請能夠提供滿足本項目采購需求且符合資格條件的其他供應商前來報名登記。

一、    公示時間:

    2015年4月23日至2015年4月30日17:30時截止。

二、    擬定采購供應商:安諾優達基因科技(北京)有限公司

三、    申請單一來源采購方式的理由:

1.總測序量不低于 320Gb clean data的數據,數據質量平均Q20≥90%,平均Q30≥85%;

2.免費提供RNA提取服務,并進行RNA質量和完整性檢測;

3.提供生物信息分析標準分析和高級分析;

4.每個樣品收費人民幣伍仟圓整(¥5,000.00)元,低于目前市場價格的60%,給與合作單位價格優惠。

5.采用型號Illumina高通量測序儀2500(V4)進行測序;

6.數據下機質控環節用安諾基因專利軟件雙質控系統,保證數據質量優越。

按以上要求,目前國內只有安諾優達基因科技(北京)有限公司的測序能完全滿足要求,故提請單一來源采購。

四、    采購項目需求:

(一)采購項目名稱:40個樣品全轉錄組測序項目

(二)項目內容:

(1)每個樣本提供8Gb clean data,數據質量平均Q20≥90%,平均Q30≥85%;

(2)對原始數據進行去除接頭、污染序列及低質量reads的處理;

(3)測序評估:比對統計、測序隨機性評估、比對上序列在染色體的分布、比對上序列在基因區域的分布、比對結果可視化;

(4)基因表達注釋:基因表達量、表達量分布、樣品聚類;

(5)基因差異表達分析(需確定比較組合)

(6)差異基因表達模式聚類分析

(7)差異表達基因GO功能顯著性富集分析:GO子類統計、GO富集  分析、富集GO q值分布

(8)差異表達基因Pathway顯著性富集分析:KO富集分析、富集KO q值分布、通路結果注釋

(9)基因的可變剪接分析:可變剪接鑒定、統計、表達量分析

(10)預測新轉錄本:新轉錄本注釋、表達量統計、差異分析

(11)SNP分析

(12)蛋白質互作網絡分析(需要蛋白互作數據庫PPI中包含該物種的注釋信息,如果PPI數據庫中沒有該物種的注釋信息,則選用近緣物種的注釋信息來進行該項分析)。

 

五、    供應商資格條件

1、供應商需滿足《政府采購法》第二十二條規定的條件;

2、本項目不接受聯合體參與談判報價。

    

六、    報名聯系方式

1、聯系人***

2、電話:***

3、地址:***

 

 

 

                    廣東順德中山大學卡內基梅隆大學國際聯合研究院

                                2015年04月23日

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